Činnost byla soustředěna na vydávání bulletinu Analýzy a Studie, který byl asi ze 70% hrazen z grantu Velvyslanectví USA, prodeje a reklamy. Náklad byl 300ks. Ústav se podílel na přípravě a vlastní pedagogické činnosti v rámci bakalářského kurzu „Bezpečnostní politika“ na fakultě sociálních studií. Vlastní činnost ústavu byla převážně hrazena z prostředků MU. Vzhledem ke vzniku obdobné instituce na Vojenské akademii v Brně a obtížnosti získávání externích finančních zdrojů byla činnost Ústavu strategických studií ukončena k 31.12.2002.